南京林业大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:32-1161/S

国际刊号:1000-2006

南京林业大学学报(自然科学版)杂志2021年第1期:大青杨PuZFP103基因的序列特征及逆境胁迫的表达分析

发布日期:

作者:张馨,马苗苗,吕婉秋,LEEJoobin,杨静莉

单位:东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150040

关键词:大青杨,PuZFP103基因,逆境胁迫,生物信息学,RT-qPCR

基金:国家自然科学基金面上项目(31870649)

【目的】通过研究大青杨(Populus ussuriensis)PuZFP103基因的序列特征及其在不同组织部位、激素处理与胁迫应答中的表达特性,为揭示PuZFP103在大青杨生长发育中的功能提供依据。【方法】利用各种生物信息学方法对PuZFP103基因进行分析,采用实时荧光定量 PCR(real time quantitative polymerase chain reaction, RT-qpCR)技术分析PuZFP103基因在不同组织、激素处理与胁迫应答中的表达模式,并用基因枪轰击法进行亚细胞定位分析。【结果】生物信息学分析发现,PuZFP103 CDS序列全长504 bp,编码168个氨基酸。分析得出PuZFP103蛋白含有ZnF-C2H2结构域,其二级结构中α螺旋、无规则卷曲和β-折叠分别占24%、84%和1%。进化树构建图显示,其与同属毛果杨、胡杨、毛白杨及番木瓜聚类到一起,亲缘关系最近。RT-qPCR分析结果显示,NaCl、脱落酸(abscisic acid, ABA)和PEG 6000胁迫处理后PuZFP103基因在大青杨叶和根中的表达量在大多数时间内相对于未处理都有所提高。另外,PuZFP103基因定位于细胞核中。【结论】PuZFP103基因在NaCl、ABA和PEG 6000胁迫处理后呈正调控的应答模式,可能参与了大青杨对渗透胁迫的代谢途径或信号传导,属于逆境胁迫下的调控因子。本研究初步证明大青杨PuZFP103基因与胁迫响应相关,但是关于其信号传导与调控机制需进一步研究。

来源:2021年第1期

《南京林业大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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