南京林业大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:32-1161/S

国际刊号:1000-2006

南京林业大学学报(自然科学版)杂志2021年第2期:33个杨柳品种指纹图谱构建

发布日期:

作者:何旭东,郑纪伟,孙冲,何开跃,王保松

单位:1.江苏省林业科学研究院,江苏 南京 211153,2.江苏省农业种质资源保护与利用平台柳树资源圃, 江苏 南京 211153,3.南京林业大学生物与环境学院,江苏 南京 210037

关键词:杨树,柳树,SSR标记,指纹图谱,亲缘关系,基因分型

基金:江苏省林业科学研究院自主科研项目(BM2018022-01),江苏省林业科学研究院青年基金项目(JAF-2016-01)

【目的】构建杨树与柳树优良品种的指纹图谱,对不同品种进行准确鉴定。【方法】利用柳树EST-SSR标记对33个杨树与柳树优良品种进行通用性检测及基因分型,通过核心引物间的组合构建品种指纹图谱。同时采用非加权组平均法进行聚类,分析各品种间亲缘关系。【结果】12个EST-SSR标记共扩增出97条等位片段,每个位点等位基因数5~13个不等,平均为8.1个。12个位点的多态信息含量(PIC)变化范围为0.637 2~0.834 8,平均为0.781 7。优选的3对核心引物中,SALeSSR0340与SALeSSR0346组合可完全区分12个杨树品种,而SALeSSR0259、SALeSSR0340与SALeSSR0346的组合可完全区分所有的33个品种。聚类分析显示33个品种间的遗传相似系数为0.68~0.96,并分成杨属与柳属两大类,与传统的杨柳科系统分类学一致。各品种间亲缘关系聚类结果与遗传背景相吻合。【结论】对33个杨柳树优良品种进行指纹图谱构建与亲缘关系分析,表明EST-SSR标记可有效反映品种间的差异,建立的基因分型体系准确、高效,可为杨树与柳树品种鉴定、保护与推广工作提供科学依据。

来源:2021年第2期

《南京林业大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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