南京林业大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:32-1161/S

国际刊号:1000-2006

南京林业大学学报(自然科学版)杂志2022年第3期:西藏石榴野生群体的SSR遗传多样性分析

发布日期:

作者:葛大朋,任媛,赵俊,王玉婷,刘学庆,苑兆和

单位:1.南京林业大学,南方现代林业协同创新中心,南京林业大学林学院,江苏 南京 210037,2.西藏自治区林木科学研究院,西藏 拉萨 850000,3.山东省烟台市农业科学研究院,山东 烟台 265500

关键词:石榴野生群体,SSR,遗传多样性,遗传结构,西藏

基金:西藏自治区自然科学基金项目(XZ2019 ZR G-153),国家自然科学基金项目(31901341),江苏省自然科学基金青年基金项目(BK20180768),南京林业大学高层次人才科研启动基金项目(GXL2014070),南京林业大学高层次人才科研启动基金项目(GXL2018032),江苏高校优势学科建设工程项目(PAPD)

【目的】调查西藏地区野生石榴种质资源,分析西藏野生石榴群体的遗传多样性和遗传结构,为野生石榴资源的保护和利用提供理论依据。【方法】使用13对SSR引物对3个自然群体共42份西藏地区野生石榴种质资源材料DNA进行PCR扩增,毛细管电泳检测扩增片段长度,使用GenAlEx和Arlequin等软件对SSR数据进行分析。【结果】13对引物共检测到44个等位基因,平均3.385个,引物的平均有效等位基因数(Ne)、香农信息指数(I)、期望杂合度(He)和多态信息量(PIC)分别为1.971、0.771、0.481和0.393。3个野生群体的平均有效等位基因数(Ne)、平均香农信息指数(I)和平均期望杂合度(He)分别为1.867、0.646和0.421,林芝b(LZb)群体的遗传多样性水平高于其他2个群体。AMOVA分析表明,群体内遗传变异高达88.43%,3个群体间的遗传分化系数(Fst)为0.116。种质聚类分析将供试种质划分为3个亚群,结果与种质地理来源具有一定关联性。遗传结构分析显示西藏野生石榴有4个可能的基因库来源。【结论】13对SSR引物可用于西藏野生石榴种质的遗传多样性等研究。西藏野生石榴种质的遗传变异主要存在于群体内;林芝b(LZb)群体遗传多样性最高,遗传结构复杂,且含有最多的野生种质采样点,可予以优先保护。

来源:2022年第3期

《南京林业大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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