南京林业大学学报(自然科学版)

作者：马秋月,王玉虓,李倩中,李淑顺,闻婧,朱璐,颜坤元,杜一鸣,解志军,李淑娴,欧阳芳群,鲁成代

单位：1.江苏省农业科学院休闲农业研究所,江苏 南京 210014,2.南京林业大学林学院,南方现代林业协同创新中心,江苏 南京 210037,3.襄阳市林业科学技术推广站,湖北 襄阳 441000,4.北京市植物园,北京 100093,5.天水市五小叶植物保护研究所, 甘肃 天水 741000

关键词：槭属,基因组大小,流式细胞术,K-mer分析

基金：国家自然科学基金项目(32001357),江苏省自然科学基金项目(BK20211139),国家重点研发计划(2022YFD2200401)

【目的】 槭属植物种类繁多,具有观赏、油用、药用等重要价值,开发应用前景广阔。基于流式细胞术和K-mer分析方法,首次进行6种槭树基因组大小测定,为槭属植物分子生物学、细胞学研究提供重要理论参考。【方法】 以6种槭树嫩叶为材料,WPB为细胞核解离液,大豆(Glycine max ‘Polanka’)和玉米(Zea mays CE-777)为内标,利用流式细胞检测技术和K-mer 分析法估测6种槭树的基因组大小。【结果】 基于流式细胞术测定建始槭(Acer henryi)、三角枫(A. buergerianum)、秀丽槭(A. elegantulum)、血皮槭(A. griseum)、五小叶槭(A. pentaphyllum)和青楷槭(A. tegmentosum)的基因组大小分别为(691.12±8.69)、(863.90±8.69)、(896.50±4.35)、(893.24±8.69)、(766.10±8.69)和(1 154.04±13.04) Mb;以K-mer 分析法估测的基因组大小分别为561.72、743.00、777.87、771.51、650.64和1 103.46 Mb;杂合率分别为1.00%、1.24%、1.31%、1.08%、0.28%、0.81%。K-mer分析法估测的基因组大小略小于流式细胞术预测结果。【结论】 本研究的结果可丰富槭属植物基因信息库,也可为该属植物基因组学、分子细胞遗传学等研究奠定重要基础。

来源：2023年第1期

《南京林业大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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