国内刊号:32-1161/S
国际刊号:1000-2006
发布日期:
作者:姚俊修,任飞,王因花,李庆华,燕丽萍,郑岩,吴德军
单位:1.山东省林业科学研究院,山东省生态林草遗传育种重点实验室,山东 济南 250014,2.山东高速鸿林工程技术有限公司,山东 济南 250101
关键词:荧光SSR标记,接骨木,种质资源,遗传多样性
基金:山东省重点研发计划(农业良种工程)(2020LZGC0905),中央财政林业改革发展资金项目(鲁[2024]TG05号),山东高速集团科技创新项目(SDGSHL-2024-009)
【目的】以收集的245份接骨木属(Sambucus)种质资源和60份接骨木杂交种质为材料,基于SSR分子标记对不同种源接骨木的遗传多样性及亲缘关系进行分析,为接骨木种质资源的合理保护、评价与利用提供科学依据。【方法】以11个种源的305个体为研究对象,根据转录组测序结果,开发100对SSR引物,对8个不同种接骨木个体进行扩增筛选,获得13对多态性较好的SSR引物,使用Popgene、Genemarker、GeneALeX和NTSYSpc等软件,对接骨木种质资源及杂交子代的遗传多样性、遗传距离、不同种源主坐标、UPGMA关系及进化树等进行分析。【结果】利用13对荧光引物对305个体进行扩增,检测到等位基因总数为162,不同位点等位基因变异幅度为4~34个,平均为12.5个;有效等位基因总数(Ne)为50.408个,变异幅度为1.066 1~11.070 2个,平均为3.878;平均观察杂合度(Ho)为0.331 5,平均期望杂合度(He)为0.521 5,平均Nei’s遗传距离为0.520 4,平均多态性信息含量为0.496 4,表明遗传多样性较高;42号位点Ho/He大于1,表明该位点杂合度高,种群内遗传变异程度较大。不同种源参试样本中Ho为0.208(杂交组合1)~0.486(长白县),平均Ho为0.372。He为0.242(杂交组合1)~0.552(大庆),平均He为0.434,其中,长白县、朝鲜种源及杂交组合2的Ho/He均大于1,表明这3个种源/杂交组合内群体杂合度较高,种群内遗传变异程度也较大。主坐标分析表明:遗传变异主要存在于个体间,占80%,而种源间遗传变异仅占20%,可能由于不同地区的栽培种源来源于相同省域,造成不同种源间变异较小;Nei’s遗传距离和聚类结果表明,种源/杂交组合间的遗传距离变化范围为0.023~0.637,山东青州仰天山天然群体和吉林长白县的遗传分化差异最大;内蒙赤峰和新疆阿勒泰的遗传分化差异最小;聚类可分为3大类群,同一种源个体并未完全聚到相同分支,可能原因是遗传变异或相互引种造成的。【结论】 接骨木种质资源具有较高的遗传多样性,在进行接骨木遗传改良时,应首先进行种源内选择育种及单株改良的育种方法,其次可考虑种源间研究。研究结论为接骨木种质资源精准鉴定、核心种质构建及新品种创制等奠定基础。
来源:2025年第2期
《南京林业大学学报(自然科学版)》期刊编辑部