南京林业大学学报(自然科学版)

作者：朱跃,张敏,张成,麻璨璨,严继萍,段一凡,王贤荣

单位：南京林业大学, 南方现代林业协同创新中心,南京林业大学生命科学学院, 江苏 南京 210037

关键词：桂花,基因组,SSR,引物开发

基金：江苏省自然科学基金青年基金项目(BK20200786),中国博士后科学基金项目(2019M651839)

【目的】桂花(Osmanthus fragrans)为我国十大传统名花之一,然而花期短,花型、花色差异小等原因导致其从传统形态学上进行品种鉴定较为困难。基于全基因组序列进行SSR引物的开发,有利于为桂花的品种鉴定、遗传多样性分析等研究提供技术支持。【方法】利用MISA软件对桂花全基因组上的SSR位点进行查找和分析,并使用Primer 3进行引物设计,从中挑选131对引物进行多态性验证。【结果】在桂花全基因组序列中共获得180 838个SSR位点,平均4.10 kb出现1个位点。其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸为主要的重复类型,分别占SSR总数的42.59%、39.03%和14.13%;二核苷酸重复类型中,以AT和AG基元为主;三核苷酸重复类型中,以AAT、ACC和AAG基元为主。将挑选合成的131对引物在银桂、金桂、丹桂、四季桂4个品种群的32个品种中进行毛细管电泳测序,其中16对位点呈现多态性;单个位点等位基因数为4~16,平均每个位点等位基因数为8.94。【结论】开发的16对桂花SSR引物多态性高,可用于桂花的品种鉴定、遗传多样性分析和指纹图谱构建等方面的研究。

来源：2025年第5期

《南京林业大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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