南京林业大学学报(自然科学版)

北大核心,CA,JST,CSCD,WJCI

国内刊号:32-1161/S

国际刊号:1000-2006

南京林业大学学报(自然科学版)杂志2025年第6期:小果白刺bHLH基因家族鉴定与表达分析

发布日期:

作者:张建军,吴京乡,方昊,朱礼明,成铁龙

单位:1.南京林业大学生态与环境学院,南方现代林业协同创新中心,江苏 南京 210037,2.林木遗传育种全国重点实验室(南京林业大学),江苏 南京 210037

关键词:小果白刺,bHLH转录因子,盐胁迫,基因表达

基金:国家自然科学基金项目(31770715)

【目的】基本螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子在植物的生长、代谢和对生物/非生物胁迫的响应等过程中发挥着重要作用。进行小果白刺(Nitraria sibirica)bHLH全基因组鉴定与生物信息学分析,可为后续bHLH基因克隆和进一步生物学功能研究提供参考。【方法】用生物信息学和分子生物学方法,在全基因组水平对小果白刺bHLH基因家族进行系统进化分析并利用转录组数据及定量qRT-PCR分析小果白刺bHLH基因家族对盐胁迫的响应。【结果】基于小果白刺基因组数据共鉴定出88个bHLH转录因子,不均匀地分布在12条染色体上,并有2对串联重复基因,根据系统进化树可将其划分为16亚群;顺式作用元件分析显示,88个bHLH转录因子含有多种与环境和胁迫相关的顺式作用元件;基因表达模式分析表明,小果白刺bHLHs在盐胁迫过程中响应程度不一,qRT-PCR结果显示6个bHLH基因在不同组织中表达特异性显著;盐胁迫下,bHLH1、bHLH24、bHLH70、bHLH73在叶中表达显著上调,而bHLH2、bHLH30在叶中的表达下调;在根中这6个基因表现出相同的表达模式,均显著上调;在茎中除了bHLH2有下调表达外,其他5个基因均为上调表达。【结论】鉴定出88个小果白刺bHLH转录因子,其基因结构和结构域较保守,染色体上有2对串联重复基因;盐胁迫处理后,小果白刺bHLH基因家族成员发生响应,在根、茎和叶中均有表达,可能与该家族成员具有抗盐功能有关。该研究为进一步阐明小果白刺bHLH转录因子家族基因的功能奠定基础。

来源:2025年第6期

《南京林业大学学报(自然科学版)》期刊编辑部

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